无酸纸档案盒具备一定防潮性，但在高湿环境仍需科学存放以延长寿命。库房应控制温度 14—24℃、相对湿度 45%—60%，配备通风与除湿设备，避免地面返潮。档案盒需放置在密集架、档案柜内，不直接接触地面与墙壁，底部垫高 10 厘米以上。
梅雨季节定期通风，减少霉菌滋生；盒体避免阳光直射，防止纸板老化变脆。归档前确保文件完全干燥，不将潮湿材料装入盒内。轻微受潮可在阴凉通风处晾干，不可暴晒或高温烘烤，以免变形开裂。
定期检查盒体有无霉点、软化、变形，发现问题及时处理。规范存放可使无酸纸档案盒保持稳定性能，持续保护档案不受潮、不霉变、不酸化。