对于招标审计来说，由于工程施工招投标审计为事后审计， 加上违规手段隐蔽， 往往存在较大审计风险， 在审计过程中应更加注重审计程序到位，掌握招投标审计的重点和方法。 注意审查招标过程中有无人为的压价、哄抬标价或泄露标底的现象，审计人员可以通过查阅比对标底和各家投标单位的投标文件来发现其中的端倪。
建设工程项目招投标专业性强、涵盖面广、体系庞杂，审查工作包括查看招投标文件、现场签到表等相关书面资料，将同一项目不同投标单位的投标文件进行对比，将不同时间段或不同项目的表述进行对比，利用互联网进行各投标单位相关资料查询等：
利用互联网进行各投标单位相关资料查询(例如核实联系电话、公司名称等，可能会发现不同公司联系人号码相同、公司信息有相关性等等问题)、查工商注册资料(例如通过相关机构查询公司股东构成等资料，可能存在不同公司具有相同关联人信息的现象)、查人(例如针对同一个人进行地毯式调查，可能会发现同一人与其他投标单位的内在关系)；对相关工程材料设备等进行询价比对，了解投标单位报价的合理性。
查看招投标文件、现场签到表以及其他相关书面资料找出疑点，制定一个粗略的审查方向。如不同电话号码的联系人相同、授权人姓名错误、投标单位名称错误、公章盖错等细节问题。将同一项目不同投标单位的投标文件进行对比，可能存在投标书排版相似、字体相似、错误相同、纸张相似、明细报价表顺序相同等问题；将不同时间段或不同项目的标书进行对比，可能会产生同一人员不同时间代表不同公司投标或是同一份模板及编制手法出现在不同时间段的不同单位投标文件中等现象。
投标文件一般分为商务部分、技术部分和报价部分，分开来说：
商务部分：包括投标函、法定代表人身份证明、授权委托书、联合体协议、投标保证金、资格审查资料、其他资料等
技术部分：包括具体施工方案、进度计划、施工平面布置图、人、材、机计划表等
报价部分：主要由造价人员依据工程量清单或图纸来确定报价。